Kegiatan pengukuran kualitas perairan ini dilaksanakan pada sekitar pukul 10.00 WIB, dengan parameter yang diukur antara lain adalah suhu, salinitas, pH, dan kecerahan perairan. Parameter tersebut diukur menggunakan beberapa alat ukur, diantaranya adalah salinometer, yang berfungsi untuk mengukur salinitas sekaligus suhu perairan, pH meter untuk mengukur pH perairan, dan secchi disk untuk mengukur kecerahan perairan. Adapun titik pengukuran disebar pada empat lokasi, yakni kawasan docking, kawasan Selatan Kios Ikan Nelayan, kawasan dermaga selatan TPI, dan kawasan dermaga timur TPI. Dari empat titik yang diukur, diperoleh bahwa parameter suhu berkisar antara 24,3 – 27,1 derajat Celsius, parameter salinitas berkisar antara 23,5 – 24,1 ppt, parameter pH berkisar antara 9,03 – 9,07, dan kecerahan perairan berkisar antara 100 – 310 cm. Dari hasil pengukuran diperoleh bahwa pengukuran pH rata – rata berada di atas ambang baku mutu, yakni 6,5 – 8,5. Hal ini disebabkan pada saat pengukuran, terdapat aktivitas pembongkaran dan pembersihan kapal perikanan yang umumnya membuang limbah berupa air cucian yang bersifat basa dan mampu meningkatkan nilai pH. Sementara pada parameter kecerahan, kecerahan maksimal (310 cm) berada pada rentang baku mutu dimana kecerahan perairan disekitar pelabuhan diharuskan mampu melebihi 300 cm. Sementara itu, parameter suhu dan salinitas masih berada di batas ambang baku mutu.